经过马丁路德在德国、加尔文在瑞士以及英国王室在英格兰这三地的初步改革，改教已经成了各方面的共识。接下来，改教风潮在欧洲继续蔓延，最终席卷整个教会。

深化改革的首先是德国的基督新教。虽然德国的宗教改革获得很多王侯支持，但神圣罗马帝国皇帝始终想要压制这个改革的势头。之前因土耳其军队的威胁，皇帝不得不采取容忍的政策，但当外部威胁消退之后，他仍旧决定以武力来解决他视为异端的路德。支持改教的王侯因此组成一个军事同盟，不单是要维护自己的信仰立场，也想借此抗拒皇帝对德国的干涉。最后战争爆发了，皇帝打败了改教王侯的联盟，甚至攻陷了改教的大本营威登堡。不过，此时宗教改革已经深入人心，再加上德国人不满西班牙军队占领德国，抗拒神圣罗马帝国皇帝的气氛日渐增加；皇帝虽然军事上得胜了，但在宗教事务上却没有任何进展。1555年，神圣罗马帝国皇帝同意撤兵，并与当地王侯签订《奥斯堡合约》，正式承认德国改教教会拥有合法地位。从此，德国教会可以名正言顺地在原先基础上进行发展，路德在德国教会的改革努力终于成功了。