1937年7月7日，日本军队展开全面侵华行动。国民政府决定撤离沿海无险可守的平原地区，将首都从南京迁至重庆，并号召全国人民随政府向西部内陆迁移，以便集中有限资源进行长期战斗。当时中国民间积极回应政府号召，许多学校、工厂、机构纷纷跟随政府的脚步，向西部和西南部搬迁。大批不愿留在沦陷区生活的国民也选择向内陆地区迁移。这是中国历史上最大规模的一次人口迁徙。伴随着这一次大迁徙，大批原本生活在沿海地区的人才也来到了中国内陆，当中包括许多沿海地区的教会领袖。

中国沿海地区一向较为开放、发达，在资源和人才方面一般比内陆更丰富，就连基督教的事工也是如此。原先中国教会的根基、差会的总部大多在北京、上海、广州等沿海大城市。日本人占领了这些地区后，大批领袖离开，整个教会处境艰难。

首先，中国教会虽已力求本土化，但当时许多事工仍然需要接受西方协助，特别是在经济方面，尤其依赖外国教会的辅助。这时候，战争使得参战国的教会也面对了严重的资源短缺。特别是1941年日本偷袭珍珠港后，美国也卷进了这场世界大战当中，中国教会能够得到的支援就更加匮乏了。此外，日军占领了沿海地区之后，强制对所有教会活动进行登记，又给教会活动设下诸多限制，很多教会事工被迫停顿。部分教会选择从沿海地区搬迁到内地，却发现内陆地区各方面的条件都不如沿海，一时之间适应不了，事工顿时萎缩了。